Il Bosco di Supersano è uno degli ultimi lembi di foresta naturale del basso Salento, caratterizzato da una straordinaria ricchezza di specie vegetali e animali tipiche della macchia mediterranea e della foresta a querce (soprattutto Quercus virgiliana e Quercus ilex).
La sezione naturalistica del museo documenta l’ecosistema forestale attraverso campioni botanici, preparati faunistici e pannelli illustrativi che raccontano le relazioni ecologiche tra le specie del bosco. Tra le specie di maggiore interesse si segnalano diverse orchidee selvatiche, il lentisco (Pistacia lentiscus), il mirto (Myrtus communis) e numerose specie di uccelli migratori e stanziali.
La fauna comprende mammiferi come la volpe, il riccio e la lepre, rettili come il colubro e la lucertola campestre, e un’abbondante avifauna caratterizzata da upupa, ghiandaia, picchio, allocco e molte altre specie legate all’ambiente boschivo.